La città si trova nel punto più alto di un colle e attualmente il comune è composto da circa 1000 abitanti.
Fragneto L’Abate ha origine nell’alto medioevo, anche se alcuni ritrovamenti archeologici indicano che i centri abitati esistevano in epoca romana.
In epoca longobarda, il territorio fu donato dai principi di Benevento al loro tesoriere Fotone. Successivamente, in epoca normanna, nel 1099, il territorio fu acquistato dal conte di Ariano (Eribertus) e poi donato al Monastero di Santa Sofia di Benevento. Da quel momento, il villaggio venne chiamato “Fragneti Abbatis”.
Nel 1763, Ferdinando IV di Borbone sottrasse al potere della Chiesa la proprietà del territorio, aggregandolo prima alla Corte Regia, e poi donandolo al cardinale Fabrizio Ruffo. La famiglia Ruffo rimase in possesso del territorio fino all’abbandono del sistema feudale. Dopo l’Unità d’Italia, Fragneto L’Abate fu accorpato alla provincia di Benevento.